Sakura Matou đã hấp thụ rất nhiều linh hồn, bị thống trị bởi tất cả ác quỷ trên thế giới, và trở thành một hóa thân của Chén Thánh Đen. Pháp sư “Master” và linh hồn “Servant” chiến đấu để giành lấy “Chén Thánh”. Shiro Emiya, một cậu bé thề sẽ bảo vệ Sakura, đã cùng chiến đấu với Rin Tohsaka và ném mình vào một trận chiến khắc nghiệt để kết thúc “Cuộc chiến Chén Thánh”.